Faire sa comptabilité en reportant dans une liasse papier, une pratique devenue quasi insolite en 2026 ? Si quelques irréductibles font encore ce choix, la majorité des entrepreneurs adoptent désormais des solutions de comptabilité en ligne tant le gain de temps offert par la technologie est considérable. En quelques années, les cabinets comptables se sont digitalisés et les logiciels de comptabilité sont devenus très performants. Alors concrètement, qu’attendre d’une offre de comptabilité en ligne en 2026 ? Zoom sur les nombreux avantages à faire sa comptabilité en ligne aujourd’hui.
Qu’est-ce que la comptabilité en ligne ?
La comptabilité en ligne en 2026
Aujourd’hui, il existe deux façons de réaliser sa comptabilité en ligne.
La première prend la forme d’un logiciel de comptabilité adopté en version gratuite ou payante, il s’agit tout simplement d’une solution numérique qui permet d’y tenir sa comptabilité. Généralement, elle fonctionne en mode SaaS et permet de centraliser les factures, d’effectuer un rapprochement bancaire, de créer et récupérer les déclarations fiscales et, pour finir, de réaliser le compte de résultat.
Autre possibilité : faire sa comptabilité en ligne avec un cabinet d’expertise comptable exerçant en ligne et mettant à disposition de ses clients une plateforme comptable. Ces offres se sont beaucoup répandues ces dernières années car elles offrent une flexibilité appréciée par les entrepreneurs et un niveau d’autonomie variable selon le profil et l’aisance du chef d’entreprise.
Les avantages de la comptabilité en ligne
Faire sa comptabilité en ligne représente de nombreux avantages pour les entrepreneurs. Premièrement, c’est un service rapide et simple à mettre en place. Cela permet d’automatiser une partie des tâches comptables : un gain de temps bienvenu dans un quotidien entrepreneurial qui demande de porter à la fois la casquette du comptable mais aussi du commercial, du chef de produit, du RH, etc.
- Une accessibilité à tout moment : les données comptables sont sauvegardées sur un serveur sécurisé et restent accessibles à tout moment. Par exemple, un entrepreneur en déplacement peut vérifier depuis son téléphone si une facture à été payée.
- Une économie de temps et d’argent : la plupart des logiciels comptables synchronisent les comptes bancaires et associent automatiquement les opérations aux factures. Cela fait gagner du temps et coûte souvent moins cher qu’un cabinet traditionnel, même si ceux-ci évoluent aussi avec l’automatisation de certaines tâches.
- Une gestion plus complète : souvent, les logiciels comptables en ligne regroupent plusieurs fonctionnalités : services, édition de devis et de factures, notes de frais, trésorerie et comptes annuels. Ils peuvent aussi accompagner l’entrepreneur dans ses déclarations fiscales et sociales.
- Un coût généralement déductible : L’abonnement à un logiciel de comptabilité peut être déduit du résultat imposable s’il est lié à l’activité, justifié par une facture et correctement comptabilisé.
Différence entre la comptabilité traditionnelle et en ligne
Il est essentiel de bien saisir la distinction entre les deux types de comptabilité (traditionnelle et en ligne), afin de sélectionner celui qui est le plus adapté à votre entreprise et à vos besoins.
| Critères | Comptabilité traditionnelle | Comptabilité en ligne |
| Accès aux données | Sur demande et lors des horaires d’ouverture du cabinet | A tout moment, 24H/24 |
| Tarif (approximatif) | De 2000 à 3000 € HT / an pour une TPE | Environ 1500 € HT / an |
| Inscription OEC | Oui | Oui |
| Adapté à | TPE, PME, ETI, GE | Auto-entrepreneur, freelances, PME /TPE |
| Transmission des documents | Par courrier, e-mail ou remise en main propre | Dépôt direct sur une plateforme sécurisée |
| Rendez-vous | En présentiel | Téléphone, visioconférence ou email |
Un expert-comptable en ligne est un spécialiste qui réalise ses prestations grâce à une plateforme numérique. Il doit être titulaire d’un DEC (Diplôme d’Expertise Comptable) et inscrit à l’Ordre des Experts Comptables. Il peut gérer à distance tous les aspects de la comptabilité, de la tenue des comptes, aux conseils financiers, fiscaux et juridiques. Il va bien souvent proposer un tarif plus accessible que les cabinets traditionnels compte tenu de son absence de loyer à payer, Ses services concernent aussi bien les freelances, que les PME et TPE.
Ainsi, comme vous l’aurez compris pour bénéficier des services d’un cabinet d’expertise comptable, en ligne, il faut une bonne connexion web et une bonne maîtrise des nouveaux outils digitaux. Si vous n’êtes pas à l’aise avec l’utilisation de logiciel en autonomie, un cabinet de proximité proposant des rendez-vous physiques sera préférable.
Aussi, certains services en ligne ne sont pas adaptés à toutes les entreprises. Par exemple, certains commerçants ou artisans peuvent avoir besoin d’un suivi plus proche et régulier. Faites le point avec un conseiller.
Si en faisant votre étude, vous avez constaté que certains prix affichés semblaient très compétitifs, méfiez-vous. Attention aux fonctionnalités qui nécessitent finalement de payer un supplément, comme le bilan comptable ou les déclarations de TVA… Vous devez également vous aussurer de la protection des données sensibles de votre entreprise. N’hésitez pas à questionner votre cabinet comptable en ligne sur ce sujet.
Logiciel de comptabilité ou expert-comptable en ligne : quelle solution choisir pour son entreprise ?
Un logiciel de comptabilité permet de simplifier de nombreuses tâches du quotidien, comme la facturation, le suivi des dépenses ou la saisie des écritures comptables. Cette solution est souvent adaptée aux micro-entrepreneurs, freelances ou petites entreprises qui ont une comptabilité relativement simple et souhaitent gérer eux-mêmes leurs obligations.
En revanche, lorsque l’activité se développe ou que les obligations comptables deviennent plus importantes, obtenir le conseil d’un expert-comptable en ligne est souvent plus rassurant. Les sociétés comme les SARL, SAS ou certaines SCI doivent respecter des règles comptables et fiscales plus complexes, qui demandent un suivi professionnel et des conseils adaptés.
La principale différence entre ces deux solutions est que le logiciel est un outil qui facilite la gestion comptable, tandis que l’expert-comptable va apporter un véritable coaching financier à l’entrepreneur.
En choisissant un cabinet en ligne comme Amarris Expertise Comptable, vous profitez à la fois d’un logiciel de comptabilité tout en bénéficiant des conseils d’un professionnel inscrit à l’Ordre des Experts-Comptables. Vous gagnez ainsi du temps, tout en ayant l’assurance que votre comptabilité est conforme aux attentes de l’administration.
Comment choisir son cabinet comptable en ligne ?
Quelles sont les vérifications à faire pour sélectionner votre cabinet ?
L’inscription à l’Ordre des Experts-Comptables
C’est la première des informations à rechercher. Si vous voulez déléguer la production des tâches comptables, vous devez vous assurer de les confier à un professionnel sérieux. Pour cela c’est facile, il vous suffit de consulter ce répertoire : Annuaire des experts-comptables
L’offre de services
Prenez le temps d’écrire vos besoins. Sont-ils tous prévus dans la lettre de mission ?
Vous avez des perspectives d’évolution rapides pour votre activité ? Vous voulez embaucher ou optimiser votre patrimoine personnel ? Le cabinet que vous avez choisi sera-t-il capable de vous accompagner lors de ces changements ?
Le logiciel de comptabilité mis à disposition
Aujourd’hui, l’intelligence artificielle révolutionne de nombreuses tâches. Une plateforme de comptabilité moderne peut vous faire gagner un temps considérable : jusqu’à plusieurs heures par mois.
La tarification
Le tarif proposé est-il adapté à l’enveloppe que vous vouliez allouer à ce type de service ? Et surtout, que comprend ce tarif ? En cas de demande supplémentaire, quels sont les prix qui s’appliquent ?
La disponibilité
Un comptable, même s’il exerce en ligne, est un collaborateur essentiel pour le bon développement de l’entreprise. Vous devez pouvoir le contacter facilement, lui soumettre vos questions et le consulter régulièrement pour prendre les bonnes décisions.
La réputation
Ce n’est pas toujours facile de deviner le sérieux d’un professionnel. Et si vous demandiez conseil à vos pairs ? Si vous ne connaissez pas d’entrepreneur ayant eu recours au cabinet comptable qui vous a séduit, commencez par consulter les avis disponibles en ligne. En cas de doute, demandez lui des références.
Quels sont les meilleurs cabinets comptables en ligne ?
| Cabinet | Création | Tarif | Profils concernés | Services et outils | Note clients | Principal avantage |
| Amarris Expertise Comptable | 1999 | A partir de 89€ HT / mois pour les indépendants avec un conseiller comptable dédié | Indépendants, TPE et PME | Comptabilité, bilan, déclarations fiscales, facturation, trésorerie, logiciel de comptabilité et conseiller dédié. | 4.8/5 (note Google) | Accompagnement global (création entreprise, juridique, paie, domiciiliation, assurance pro) par un comptable dédié et une plateforme de gestion complèt. Un rendez-vous stratégique à mi-année et lors du bilan. |
| Dougs | 2015 | Pack liberté à partir de 79€ HT / mois – sans comptable dédié | Indépendants, TPE et sociétés | Comptabilité automatisée, déclarations fiscales, bilan et outil de pilotage. | 4.6/5 (note Trustpilot) | Logiciel intuitif et en constante évolution pour suivre son activité. Comptable dédié en option. |
| Indy | 2016 | Mise à disposition du logiciel de comptabilité gratuite – sans expert-comptable | Offre très tournée vers les indépendants, mais aussi TPE et sociétés. | Comptabilité, bilan, TVA, facturation, trésorerie, gestion financière. Comptable dédié en option. | 4.8/5 (note Trustpilot) | Solution proposant le plus d’autonomie et des forfaits ajustables selon les besoins d’intervention d’un comptable. |
| Keobiz | 2012 | Dès 89€ HT / mois avec un comptable dédié | Indépendants, TPE et PME | Comptabilité, bilan, fiscalité et accompagnement juridique et social. | 4.2/5 (note Google) | Des offres adaptées à de nombreux secteurs et un chargé de mission expert sur le métier. |
| LS Compta | 2023 | Dès 99€ HT / mois avec un comptable dédié | Indépendants, TPE et sociétés | Comptabilité, fiscalité, l’outil Pennylane, et un comptable dédié. | 4.7/5 (note Google) | Simplicité des démarches, continuité de service si le dirigeant fait sa création d’entreprise avec Legalstart. Comptable dédié sans engagement. |
Amarris Expertise Comptable
Amarris Expertise Comptable est un cabinet comptable en ligne et de proximité qui s’attache à nouer une relation de confiance avec ses clients. La collaboration se déroule en ligne ou au sein du cabinet selon la préférence de l’entrepreneur. Un comptable réactif est dédié à chaque dossier et répond dans les 24h ouvrés en cas de question, en plus des 2 rendez-vous stratégiques par an.
Le cabinet accompagne aussi bien les indépendants, les professions libérales, les artisans, les commerçants, les PME. Il a également dévélloppé une offre spécifique pour les acteurs de la santé et pour l’e-commerce.
Point fort : Amarris Expertise Comptable est un cabinet d’expertise comptable né en 1999 à Guérande, précurseur dans le domaine de la comptabilité en ligne. Aujourd’hui, c’est un groupe de + de 800 collaborateurs. Il offre ainsi une palette complète de services : comptabilité, conseil juridique, paie, droit social, assurance pro, domiciliation, plateforme de gestion, etc.
Dougs
Dougs est une société d’expertise comptable en ligne qui propose une comptabilité 100% dématérialisée. Grâce à un logiciel de comptabilité innovant, les entrepreneurs peuvent automatiser de nombreuses tâches et piloter leur activité même lorsqu’ils sont en déplacement. L’outil Dougs s’occupe essentiellement de toutes les obligations comptables et fiscales comme par exemple la préparation du bilan et les déclarations de TVA. Selon les options choisies, il peut aussi réaliser un accompagnement social, juridique et également offrir aux clients un suivi par un comptable dédié.
Point fort : un logiciel permettant l’automatisation des tâches comptables et un comptable dédié pouvant intervenir selon le besoin.
Indy
Indy est un logiciel de gestion et de comptabilité en ligne, particulièrement destiné aux indépendants et aux petites entreprises. Il permet de centraliser la comptabilité, la facturation, les comptes bancaires et le suivi de trésorerie dans une même plateforme. Il est simple et intuitif afin de permettre aux entrepreneurs de piloter facilement leur activité au quotidien.
Un accompagnement par des experts-comptables est également possible pour les entrepreneurs qui souhaitent être davantage accompagnés.
Point fort : Le service pour les entrepreneurs aimant l’autonomie et souhaitant gérer seul leurs obligations comptables et fiscales.
Keobiz
Keobiz est un cabinet d’expertise comptable en ligne, inscrit à l’Ordre des Experts-comptables, qui accompagne les entrepreneurs dans la gestion de leur entreprise. Il garantit un suivi sur les principales obligations comptables, fiscales, sociales et juridique des entreprises, en ayant un accompagnement avec des professionnels. Le cabinet met également à disposition un logiciel, de comptabilité, ce qui va permettre de suivre sa comptabilité, sa trésorerie et ses opérations financières de manière simple et centralisée.
Point fort : Keobiz accompagne une large variété de métiers et propose à ses clients un chargé de mission expert de leur secteur d’activité.
LS Compta
LS Compta est un cabinet d’expertise comptable développé par la marque Legalstart, afin d’accompagner les entrepreneurs dans la gestion de leurs sociétés. Le cabinet met à disposition un logiciel de comptabilité qui permet de faciliter la gestion financière et comptable. LS Compta propose un accompagnement qui couvre les aspects comptables et quelques démarches juridiques et sociales qui sont adaptées à de nombreux profils.
Point fort : LS Compta est adossé au groupe LegalStart qui permet d’effectuer l’ensemble des formalités de création d’entreprise en ligne.
>> Pour aller plus loin, consultez notre article comparatif sur les meilleurs experts-comptables en ligne
Comment reconnaître un bon logiciel de comptabilité ?
Fonctionnalités
Voici la liste des fonctions que vous pourrez retrouver en 2026 dans un logiciel de comptablité :
- Synchronisation bancaire et module de paiement ;
- Réalisation des factures et devis :
- Import des notes de frais :
- Réconciliation automatique :
- Echanges avec le comptable.
Nous vous conseillons de demander une démonstration en ligne pour bien comprendre comment utiliser le logiciel et optimiser son usage.
Navigation
Votre future application de comptabilité doit vous offrir une expérience utilisateur agréable, avec une interface fluide, intuitive et facile à prendre en main. Votre tableau de bord doit être clair et vous permettre de consulter vos données comptables en temps réel afin de suivre et d’analyser efficacement la situation de votre entreprise.
Conformité règlementaire et mises à jour
Grâce à votre outil de comptabilité, vous allez réaliser des déclarations et des documents attendus dans un certain format. Par exemple, une facture doit comprendre un bon nombre de mentions obligatoires. L’outil les intègre alors directement. Si la loi impose d’y faire figurer une nouvelle information, votre logiciel doit évoluer en même temps afin de vous garantir des documents conformes. Depuis septembre 2026, les solutions doivent ainsi être agréées pour la facturation électronique.
Sécurité des données
Les données partagées sont sensibles, elles doivent être stockées de manière sûre.
Services associés
Lorsque votre activité évolue, des services complémentaires sont-ils accessibles comme le conseil juridique, la paie, l’assurance pro, la rédaction des statuts ou l’audit patrimonial ? A court terme, cela vous semble peut-être secondaire, mais autant partir tout de suite avec un service que vous allez conserver longtemps et éviter de multiplier les interlocuteurs.
⚠️ Les pièges à éviter :
– Choisir deux logiciels différents pour la comptabilité et la facturation (privilégier un seul outil pour faire les deux).
– Se fier uniquement au prix sans regarder les fonctionnalités incluses.
– Choisir un logiciel non adapté à la taille ou au statut de votre entreprise.
– Négliger la protection des données et la conformité avec les obligations comptables.
La facturation électronique et la comptabilité en ligne
La facturation électronique fait évoluer la gestion de la comptabilité en ligne, sans pour autant la transformer radicalement. Les entreprises doivent dorénavant utiliser une solution compatible et conforme à la réforme ou une plateforme agréée pour émettre et recevoir leurs factures électroniques.
Rappel du calendrier :
- 1er septembre 2026 : toutes les entreprises doivent recevoir des factures électroniques. Depuis cette date, les grandes entreprises et les entreprises de taille intermédiaire (ETI) doivent également les émettre en format électronique.
- 1er septembre 2027: l’obligation d’émettre les factures électroniques s’étendra aux petites et moyennes entreprise (PME), ainsi qu’aux très petites entreprises (TPE).
Les données des factures sont directement intégrées dans la comptabilité en ligne, ce qui permet de réduire les erreurs de saisies. Les experts-comptables en ligne peuvent également accéder plus rapidement aux documents de leurs clients, vérifier les informations transmises et les accompagner efficacement dans cette transition.
Les 10 bonnes pratiques de la comptabilité en ligne
Pour bien gérer sa comptabilité en ligne, avec ou sans accompagnement d’un expert-comptable en ligne, il est essentiel d’adopter quelques bonnes pratiques au quotidien :
1. Définissez clairement vos missions et celles de votre expert-comptable en ligne : transmission des documents, saisie, vérification des opérations, déclarations fiscales ou encore établissement des comptes de résultats.
2. Connectez votre compte bancaire professionnel à votre espace comptable sécurisé afin de faciliter l’importation et le suivi des opérations.
3. Transmettez régulièrement vos factures, notes de frais et autres justificatifs, n’attendez pas la fin du mois ou de l’exercice pour les envoyer à votre expert-comptable.
4. Classez correctement vos documents et associez chaque transaction au justificatif correspondant pour éviter les erreurs de saisies.
5. Contrôlez les opérations qui sont catégorisées automatiquement, une vérification humaine reste indispensable.
6. Effectuez régulièrement un rapprochement bancaire pour vérifier que les montants enregistrés correspondent bien aux mouvements présents sur votre compte professionnel.
7. Suivez vos factures clients et fournisseurs, vos notes de frais, les paiement reçus, les échéances et également les éventuels retards de règlement.
8. Consultez régulièrement votre tableau de bord pour suivre votre chiffre d’affaires, votre trésorerie, votre compte de résultat et votre rentabilité.
9. Respectez les échéances fiscales et sociales, notamment pour la TVA. Votre expert-comptable en ligne peut préparer et transmettre certaines déclarations, mais vous devez lui fournir les informations nécessaires dans les délais demandés.
10. Echangez régulièrement avec votre expert-comptable en ligne par téléphone ou visioconférence, n’attendez pas la clôture annuelle pour lui poser vos questions ou lui signaler un changement important.
Toutes vos questions sur la comptabilité en ligne
Aucun texte n’impose le recours à un expert-comptable, sauf dans des cas très spécifiques comme la certification des comptes pour certaines structures dépassant des seuils précis de chiffre d’affaires ou d’effectifs.
Il donc possible de réaliser sa comptabilité en toute autonomie à condition de disposer d’une connexion internet fiable et de choisir un bon logiciel de comptabilité, adapté à son statut et à ses obligations légales.
Un auto-entrepreneur avec un faible volume de transactions pourra gérer seul ses opérations sans difficulté majeure. La réalité peut être un peu plus complexe pour les sociétés : les obligations comptables y sont plus lourdes, le risque d’erreur plus élevé. Déléguer à un professionnel reste alors souvent le meilleur choix, notamment pour sécuriser les déclarations fiscales et établir les comptes annuels.
Oui, la comptabilité en ligne convient aux SASU et aux SARL. Elle permet d’automatiser une partie de la gestion comptable, de centraliser les factures et justificatifs et de suivre plus facilement la situation financière de la société.
Le tarif d’un logiciel comptable en ligne dépend des fonctionnalités offertes, du statut juridique et du niveau d’accompagnement proposé (par exemple, le service comprend-il le suivi par un comptable dédié disponible en cas d’interrogation ?). Certaines offres sont gratuites, tandis que les solutions les plus complètes coûtent plusieurs dizaines d’euros par mois.
De nombreux logiciels de comptabilité gratuits permettent de réaliser soi-même certaines opérations, comme l’édition de factures, le suivi des dépenses ou encore la centralisation des justificatifs. Toutefois, les versions gratuites de logiciel sont souvent limitées et n’intègrent pas toujours la réalisation des déclarations de TVA, de la liasse fiscale, l’établissement des comptes annuels ou encore une assistance par un professionnel.
Oui, avant de vous engager, nous vous conseillons de comparer plusieurs devis afin de vérifier les services inclus, les fonctionnalités de la solution proposée et le détail de l’accompagnement.
Amarris Expertise Comptable propose une solution complète avec un comptable dédié et un suivi personnalisé. Contactez-nous pour réaliser un devis d’expertise comptable.
Dans le cas d’une entreprise individuelle ou d’une petite structure, le logiciel de comptabilité idéal est celui qui s’adapte à l’entreprise, son secteur d’activité et son régime fiscal. Mais, il faut surtout une solution simple d’usage pour un entrepreneur avec un agenda déjà bien rempli, offrant une sauvegarde automatique des données et une vision claire de la trésorerie sur le tableau de bord.
Oui, de nombreux cabinets comptables en ligne comme Amarris Expertise Comptable proposent des formules hybrides associant un travail autonome sur logiciel et l’appui d’un comptable pour les tâches demandant plus d’analyse et de technicité métier.
Solliciter l’avis d’un expert-comptable, c’est à la fois sécuriser vos déclarations, éviter des erreurs et mieux comprendre votre situation financière. Son accompagnement va aussi vous aider à prendre des décisions adaptées et à gérer sereinement votre activité.
Un auto-entrepreneur peut se satisfaire d’un logiciel de comptabilité gratuit, car son volume d’opérations reste généralement faible et ses obligations limitées. En revanche, pour tout autre statut, en prenant en compte les obligations qui en découlent, nous vous conseillons de choisir un véritable logiciel comptable comprenant des mises à jour règlementaires régulières.
